故事發(fā)生于位于本州南部的一座孤島之上，從前，這里是一片熱鬧的景象，直到有一天，一個(gè)大企業(yè)買下了島上的大部分地皮，準(zhǔn)備在這里建造工廠，很多居民因此而選擇了搬家，漸漸的，小島變得又冷青又荒蕪。星野航（中村悠一 配音）是在島上學(xué)習(xí)生活的高中二年級(jí)男生，某日，他所在的學(xué)校里轉(zhuǎn)來(lái)了一位名叫澤城凜奈（河合春華 配音）的女生。對(duì)于這個(gè)人員不斷流失的小島來(lái)說(shuō)，新鮮血液的加入是一件多么新奇的事情啊！澤城凜奈究竟為什么會(huì)從熱鬧的大城市轉(zhuǎn)學(xué)來(lái)到這座蕭條的學(xué)校里呢？沒(méi)過(guò)多久，澤城就交到了羽山海己（石川乃奈 配音）、淺倉(cāng)奈緒子（筱崎雙葉 配音）、六條宮穂（草柳順子 配音）等好友。

阿兔她們已經(jīng)升上高中了，阿兔、亞美、真琴、美奈子同考入十番高中。被封印在鏡中的死亡月亮納美妮亞女王，被一把神秘的聲音喚醒，那人替她解除封印，并煽動(dòng)她的仇恨情緒，使她對(duì)美少女戰(zhàn)士作出報(bào)復(fù)。她派出鏡之舞孃襲擊戰(zhàn)士們，并藉流星雨把鏡之碎片植入阿衛(wèi)的身體內(nèi)，慢慢控制阿衛(wèi)。為了應(yīng)付此一危機(jī)，雪奈復(fù)活并從土萌教授那里接回阿螢，去找阿遙和美智留，再次加入戰(zhàn)斗。鏡之舞孃襲擊外部戰(zhàn)士四人，仍是嬰兒的阿螢被激發(fā)出力量，幫助其餘三位外部戰(zhàn)士變成為SuperSailorUranus、SuperSailorNeptune和SuperSailorPluto。阿螢經(jīng)此一役，身體和心智迅速成長(zhǎng)，并再度醒覺(jué)，成為SuperSailorSaturn。所有美少女戰(zhàn)士齊集，集合力量使阿兔變成終極形態(tài)Eternal Sailormoon。眾人擔(dān)心阿衛(wèi)，趕到他家時(shí)，他已被納美妮亞控制，帶走了。阿衛(wèi)因?yàn)槭ケ拘?，不再?ài)阿兔，令他們的愛(ài)情結(jié)晶豆釘兔也慢慢消失。本來(lái)要變成Eternal Sailormoon是要靠眾人之力的，但阿兔救阿衛(wèi)和豆釘兔心切，竟能獨(dú)自變成Eternal Sailormoon，自己一個(gè)去納美妮亞那里救人。其他戰(zhàn)士也跟著追去，其間被納美妮亞把她們分開(kāi)，各個(gè)擊破，封印在鏡中。阿兔終於找到納美妮亞和迷迷糊糊的阿衛(wèi)，SuperSailorChibimoon就在阿兔的懷內(nèi)消失。納美妮亞訴說(shuō)自己悲慘的過(guò)去，阿兔聽(tīng)了，只感到同情、可憐她，不再憎恨她，愿意讓她報(bào)復(fù)，阿兔相信眾人都會(huì)愿意和納美妮亞做朋友的。被封印的眾戰(zhàn)士和阿衛(wèi)都感動(dòng)落淚，所有的封印解除，SuperSailorChibimoon亦重現(xiàn)世上。眾戰(zhàn)士集合力量，阿兔變成Eternal Sailormoon，引導(dǎo)納美妮亞找回她真正的夢(mèng)想。