為了救神谷薰（武井咲 飾），緋村劍心（佐藤健 飾）縱身躍入大海，昏迷中他飄到某座小島，最終為傳授了他飛天御劍流的師父比古清十郎（福山雅治 飾）所救。深感到自身與志志雄真實(shí)（藤原龍也 飾）的巨大差距，為了拯救全日本，劍心懇請(qǐng)師傅傳授他飛天御劍流的最高奧義。與此同時(shí)，志志雄劍指東京，邁出武力奪國(guó)的下一步。他強(qiáng)迫伊藤博文（小澤征悅 飾）對(duì)劊子手拔刀齋發(fā)布全國(guó)通緝令，得知消息的薰、左之助（青木崇高 飾）則匆匆向東京趕去。再度上路的劍心率先遭到御庭番眾的首領(lǐng)四乃森蒼紫（伊勢(shì)谷友介 飾）的阻擊，他一路披荊斬棘，將迎來(lái)與宿命的對(duì)手志志雄最終的對(duì)決……

1912年。為了拯救深陷重度昏迷的妹妹，聰明果敢的法國(guó)女記者阿黛拉·干白（露易絲·布爾昆 Louise Bourgoin 飾）上天入地，走遍世界尋找治病良藥。她不顧出版商去秘魯印加古果探險(xiǎn)的要求，自顧自來(lái)到埃及尋找傳說(shuō)中法老名醫(yī)的木乃伊。經(jīng)過(guò)一番險(xiǎn)象環(huán)生的對(duì)決，阿黛拉總算得到木乃伊，啟程返鄉(xiāng)。與此同時(shí)，位于巴黎的自然博物館發(fā)生奇怪之事。一枚恐龍蛋突然孵化出一只翼手龍，當(dāng)晚，翼手龍襲擊了前警察局長(zhǎng)的專車，該事件驚動(dòng)全國(guó)上下，政府要求警方24小時(shí)內(nèi)破案。即將復(fù)活的木乃伊，以及危險(xiǎn)的翼手龍，阿黛拉即將迎來(lái)新的冒險(xiǎn)……