小潛艇阿力前往海底深處執(zhí)行任務(wù)，遭遇史無前例的意外事件。小鯊魚梅莎拒絕成為爸爸獨眼鯊那樣魚見魚怕的海底霸王，內(nèi)心幻想成為小潛艇阿力一樣的海底英雄。她無意之中得到的神秘寶盒，卻把爸爸獨眼鯊變回了童年的模樣。當(dāng)寶盒離奇失蹤后，海底游樂場驚現(xiàn)神秘大怪物……
　　為探尋謎底拯救海底世界，小潛艇帶著超萌小動物們一起踏上了神奇的尋寶冒險之旅。

本片講述的是蝙蝠俠（羅杰·克雷格·史密斯 配音）以及羅賓聯(lián)合正義聯(lián)盟成員閃電俠以及綠箭俠一起對抗被稱為Animilitia的犯罪組織。該犯罪組織都是由一些動物性的成員組成，包括銀背大猩猩、獵豹女、殺手鱷魚等，他們在高譚市作惡多端，一般警察對他們束手無策。而且該組織背后的主謀卻指向蝙蝠俠的宿敵，同時也是高譚市叱吒風(fēng)云的黑道大亨企鵝人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia組織，蝙蝠俠他們這次還要面對奧斯瓦德公司的商人新發(fā)明的邪惡網(wǎng)絡(luò)動物機器人，一群犯罪惡勢力再次聚集在高譚市。