藤原拓海由于不敗的戰(zhàn)績，必然會受到新的挑戰(zhàn)。
　　《頭文字D》的第二部著重突出拓海的成長，當(dāng)然不乏激烈的挑戰(zhàn)。最經(jīng)典的要數(shù)赤誠和依呂波山路兩位老大的比拼。年輕的拓海在愛情上觸了礁，在輸給帝王車隊(duì)的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，對自己和AE86產(chǎn)生了懷疑，AE86真的有足夠的實(shí)力嗎？
　　AE86的重生來自拓海的爸爸文太，他為AE86改裝了賽車用引擎。同時(shí)，拓海遇到了同樣是AE86的強(qiáng)勁對手秋山涉。有意思的是比賽規(guī)則是在同一賽道兩車來回追趕，直到其中之一能超越對方為止，既要技術(shù)又考耐力。勝利讓拓海繼續(xù)接受這輛AE86和重拾信心回到車手的生涯。

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天才少年變廢柴遭家族排擠，未婚妻竟上門當(dāng)眾退婚；蕭炎為雪前恥立三年之約，一句豪言震驚全場：“三十年河?xùn)|，三十年河西，莫欺少年窮！”在師父藥老的幫助下，隕落天才開啟了的傳奇逆襲之路！

　　位處宇宙深處的新德克薩斯行星上，盛產(chǎn)一種稀有而珍貴的水晶，因而引得來自宇宙各地的外星人尋寶挖掘。這些開采者性格各異，有好有壞，其中名為Tex-Hex的家伙則為壞蛋中的翹楚，為了得到水晶他無所不用其極。不過Tex-Hex也有令其倍感棘手和頭疼的對手，那就是牛仔警官布雷斯塔。
　　布雷斯塔警長擁有鷹的眼睛、狼的耳朵、豹的速度和熊的力量，緊急時(shí)刻他便會召喚出相應(yīng)的獸靈附體，挫敗敵手。為了維護(hù)和平與安寧，他同邪惡勢力進(jìn)行著不懈的斗爭。

故事發(fā)生在名為霜科的高級中學(xué)里，有川姬（桑原由氣 配音）是高中二年級的學(xué)生，他雖為男兒身，但生得嬌俏可愛，因此常常被不明真相的群眾誤解。某日，有川姬遇見了糾纏不休的變態(tài)，不僅盜攝，甚至向外出售他的照片，就在有川姬焦頭爛額之際，霜科高中學(xué)生會出現(xiàn)了。就這樣，有川姬加入了只有女孩子才能夠加入的學(xué)生會，并且被規(guī)定只能穿女裝出席。個性大大咧咧常常惹是生非的副會長步18禁（摩天樓由香 配音）、運(yùn)動學(xué)業(yè)全能卻很膽小的會長運(yùn)子（小野早稀 配音）、毒舌中二的書記愛爾威爾緹娜2世（東城日沙子 配音），在這些“怪奇”少女們的圍繞下，有川姬會遭遇怎樣的命運(yùn)呢？