高町奈葉（田村由香里 配音）是一位平凡的高中三年級(jí)學(xué)生，某日，在上學(xué)的路上，她同來(lái)自異世界米德其路達(dá)的尤諾（水橋香織 配音）相遇了。尤諾告訴奈葉，她正在尋找遺落人間的太古遺產(chǎn)“圣石之種”，這種珍貴的寶物蘊(yùn)藏著巨大的能量，如果棄之不顧有可能在人間界造成巨大的破壞，接二連三的波折之后，奈葉成為了幫助尤諾回收種子的魔法少女，開(kāi)始了一段充滿了危險(xiǎn)和刺激的奇幻旅程。某日，一位名叫菲特（水樹(shù)奈奈 配音）的金發(fā)少女出現(xiàn)在了奈葉的面前，她和奈葉一樣同為回收種子的魔法少女，也就是說(shuō)，她們的關(guān)系是競(jìng)爭(zhēng)者。奈葉能夠打敗這樣一位強(qiáng)勁的對(duì)手嗎？對(duì)于菲特來(lái)說(shuō)，溫柔而又努力的奈葉又是一種怎樣的存在呢？

《百花繚亂 武士少女》是日本ホビージャパン（Hobby JAPAN）出版社創(chuàng)業(yè)40周年的跨媒體制作企畫(huà)。該企畫(huà)的小說(shuō)作者為日本的編集者、著作家·鈴木ドイツ（すずきあきら）【鈴木曉】。同時(shí)TV動(dòng)畫(huà)也預(yù)計(jì)在2010年10月開(kāi)始在獨(dú)立UHF局以及AT-X電視臺(tái)播放。但在2010年9月3日在TOKYO MX電視臺(tái)先行播放了第一話。
故事發(fā)生在21世紀(jì)初葉的日本，此時(shí)的年號(hào)是“平誠(chéng)”。雖然鎖國(guó)政策已經(jīng)完結(jié)，但德川幕府的統(tǒng)治還在繼續(xù)。在富士山的山腳有一間巨大教育機(jī)構(gòu)·武應(yīng)學(xué)園塾。這里的部分學(xué)生對(duì)德川家進(jìn)行反抗，學(xué)生會(huì)執(zhí)行部稱其為“豐臣狩獵”，并對(duì)其進(jìn)行鎮(zhèn)壓。本作的主人公、柳生道場(chǎng)的代理師傅·柳生宗朗雖世代為德川效力，但他卻對(duì)執(zhí)行部的鎮(zhèn)壓行動(dòng)抱有疑問(wèn)，為此卻被學(xué)生會(huì)命令撤走道場(chǎng)。撤走期限即將來(lái)臨之際的一天晚上，宗朗與真田幸村后藤又兵衛(wèi)被學(xué)生會(huì)直轄部隊(duì)追殺逃進(jìn)柳生道場(chǎng)秘密房間后，突然從天空墮下一名手持雙刀的全裸美少女。自稱柳生十兵衛(wèi)三嚴(yán)的少女擊退了強(qiáng)襲道場(chǎng)的服部忍者，從此之后，就有眾多日本歷史上的武將以少女身份出現(xiàn)在宗朗面前。

　　這是，某個(gè)冬日的故事。 女高中生撫子剛從靜岡搬家到山梨，為了觀賞“繪制在千元紙幣上的”富士山，騎著自行車來(lái)到本棲湖。但不巧天氣是陰天，沒(méi)能看到富士山，撫子累得當(dāng)場(chǎng)躺下睡著了。當(dāng)她醒過(guò)來(lái)的時(shí)候，時(shí)間已是深夜。在第一次到達(dá)的地方，早已忘記了回家的路途。一個(gè)愛(ài)好露營(yíng)的女孩子凜，向不安膽怯的撫子伸出了援手。為了溫暖凍僵的身體，兩人點(diǎn)燃了篝火。噼啪噼啪的柴火爆音，在靜寂的湖畔顯得沁人心脾。圍著篝火，撫子和凜一邊捧著咖喱面一邊對(duì)話。終于，兩人期盼已久的瞬間到來(lái)了。
　　“看到了……富士山……”
　　撫子與凜，由兩人的相遇而衍生的戶外系girls story開(kāi)始了。

轉(zhuǎn)學(xué)到深山中的全住宿制菁英男校，不擅長(zhǎng)運(yùn)動(dòng)的遠(yuǎn)野高志沒(méi)和好友一起加入足球社，而是選了貌似輕松又有趣的攝影社，殊不知這社團(tuán)……根本都在啪啪啪www什么攝影社，sy社才對(duì)，人稱「無(wú)節(jié)操☆Bitch社」。